自闭症儿童和成人容易出现继发性情绪障碍。很多心理研究证实，张家口自闭症患者很难确认和定义他人与自己的想法和感受。对于他们来说，不管是人际间的情感交流，还是自己内在的情感世界，都是一个未知领域，这种状况当然对他检查和管理自己的内在情绪，以及与其他人互动时表达和控制情绪的能力产生了影响。

一项针对自闭症以及执行功能的研究发现，患者具有无法抑制情感和冲动的特征，也缺乏能够影响一般执行功能的直觉能力。执行功能方面的缺陷也会影响依靠认知控制情绪的能力。临床经验发现，自闭症患者经常不加思索地直接对情感线索做出回应。这种快速又冲动的反击行为，常被视为是一种行为规范障碍，或是愤怒情绪管理方面的问题。

运用神经影像技术检测孤独症和自闭症患者大脑的相关研究发现，他们大脑中主控情感认知和调节的部位一一杏仁核，出现了结构和功能异常。杏仁核主要调节各种情绪，包括愤怒、焦虑和悲伤。神经解剖学的证据也证实自闭症患者会出现情感感知和调节的问题。

另一项研究结果指出，张家口自闭症患者可能出现面部认知困难，也就是无法看懂脸部表情。他们无法解读别人的脸部表情。普通人的大脑有一个特定区域具备处理脸部表情信息的功能，而自闭症患者似乎不具备这种能力，他们只是将别人的脸看做一个物体，而且通常只关注脸上的单一部位。这种倾向容易导致错误地解读他人的情感表达，比如，他们往往认为皱眉的动作只代表生气，其实皱眉也可能是在表达困惑的情感。普通孩子会综合考虑脸上的所有表情信号和环境氛围，来确定对方到底在传递什么情感。

心理学名词“情感表述障碍”可以描述轻度自闭症的另一个特征，即他们在确认和描述情感感受能力方面存在缺陷。临床研究结果证实，通过轻度自闭症患者在测试中的表现可以明显看出这个特征。轻度自闭症儿童和成人通常无法用较多的词汇形容情感感受状态，尤其是那些微妙和复杂的情感。